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食品污染主耍來自四個方面：
一是工業廢棄物污染農田、水源和大氣，導致有害物質在農產品中聚積；
二是隨著農業產品使用量的增加，一些有害的化學物質殘留在農產品中；
三是食品生產、加工過程中，一些化學色素、化學添加劑的不適當使用，使食品中有害物質增加；
四是貯存、加工不當導致的微生物污染。
食品受污染主要有這幾方面：
細菌性污染。這是涉及面最廣、影響最大、問題最多的一種污染，大部分食品衛生問題是由于生物因素引起的。生物性污染最主要的是致病性細菌問題，主要包括沙門氏菌、金黃色葡萄球菌、肉毒桿菌、大腸桿菌0157、李斯特氏菌等。
真菌毒素污染。真菌廣泛存在于自然界中，其產生的毒素致病性強，此外真菌還廣泛用于食品工業，新菌種的使用、菌種的變異、已使用的菌種是否產毒等問題，都應引起重視，如黃曲霉可產生黃曲霉毒素，米曲霉可產生３－硝基丙酸、曲酸、圓弧偶氮酸等。
寄生蟲。生吃水產品甚至一些其它動物肉類的行為在部分地區較普遍，使人們患寄生蟲病的危險性大為增加，部分地區的食物源性寄生蟲發病率也逐年增加。
農藥污染。隨著高效、低毒、低殘留農藥的研制和一些高毒高殘留農藥禁止使用，農藥在食品中的殘留問題也將得到改善，但由于有機氯類農藥的特點，今后一段時間內這類農藥的污染問題仍不可忽視。此外，獸藥和植物激素在食品中的殘留成為食品污染的新焦點。
重金屬污染。隨著環保意識的提高及對環境污染的控制，重金屬污染問題雖然得到逐步改善，但在短時間內使食品中的重金屬污染降至先進水平，還需進一步努力。
其它化學物污染。目前，直接應用于食品的化學物質（如食品添加劑）以及間接與食品接觸的化學物質（如農藥及污染物）日益增多。全球銷售的化學物質已達5萬多種，其中食品添加劑估計有上千種。人類長期接觸這些化學物質后可能引起的毒性（包括致畸、致癌等）反應。由于材料工業的迅速發展，食品容器、包裝材料帶來的食品污染問題也應引起重視。
防止食品污染，不僅要注意飲食衛生，還要從各個細節著手．只有這樣，才能從根本上解決問題．食品污染的防制措施主要有：
（1）開展衛生宣傳教育；
（2）食品生產經營單位要全面貫徹執行食品衛生法律和國家衛生標準；
（3）食品衛生監督機構要加強食品衛生監督，把住食品生產、出廠、出售、出口、進口等衛生質量關；冠宇儀器本著秉承“重合同、守信用、優質服務、互利雙贏”的經營理念為核心，以產品技術創新為依托、保障食品、藥品、環境、水質安全為己任 ，同時為食藥監系統、農業系統、畜牧系統、漁業系統、食品企業等提供專業的檢測產品、先進的技術支持和高效的整體解決方案。
（4）加強農藥管理；
（5）災區要特別加強食品運輸，貯存過程中的管理，防止各種食品意外污染事故的發生。